Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rbp4Q00724 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms