Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoa1Q00623 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms