Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scn1bP97952 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Scn1bP97952 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Scn1bP97952 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Scn1bP97952 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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