Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab33aP97950 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms