Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Bop1P97452 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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