Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll3P85442 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms