Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabpb2P81069 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms