Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Irx1P81068 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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