Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms