Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad54lP70270 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms