Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snrpd1P62315 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms