Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actr1aP61164 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actr1aP61164 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actr1aP61164 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actr1aP61164 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actr1aP61164 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actr1aP61164 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actr1aP61164 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Actr1aP61164 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actr1aP61164 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actr1aP61164 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actr1aP61164 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actr1aP61164 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Actr1aP61164 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actr1aP61164 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actr1aP61164 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Actr1aP61164 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actr1aP61164 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Actr1aP61164 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actr1aP61164 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Actr1aP61164 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actr1aP61164 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actr1aP61164 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Actr1aP61164 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Actr1aP61164 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Actr1aP61164 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Actr1aP61164 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Actr1aP61164 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Actr1aP61164 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms