Protein–RNA interactions for Protein: P61027

Rab10, Ras-related protein Rab-10, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab10P61027 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab10P61027 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab10P61027 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab10P61027 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab10P61027 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab10P61027 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab10P61027 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab10P61027 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab10P61027 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab10P61027 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab10P61027 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab10P61027 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab10P61027 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab10P61027 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab10P61027 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab10P61027 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab10P61027 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab10P61027 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab10P61027 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab10P61027 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab10P61027 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab10P61027 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab10P61027 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab10P61027 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab10P61027 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab10P61027 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab10P61027 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab10P61027 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab10P61027 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab10P61027 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rab10P61027 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab10P61027 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab10P61027 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab10P61027 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab10P61027 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab10P61027 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab10P61027 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab10P61027 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab10P61027 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab10P61027 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab10P61027 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab10P61027 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab10P61027 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab10P61027 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab10P61027 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab10P61027 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab10P61027 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab10P61027 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms