Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap25P60879 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap25P60879 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snap25P60879 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snap25P60879 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms