Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr3bP59470 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms