Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pdrg1P59048 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdrg1P59048 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms