Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gsc2P56916 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gsc2P56916 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Gsc2P56916 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gsc2P56916 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gsc2P56916 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms