Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms