Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lim2P56563 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms