Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bp1P55194 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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