Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NrlP54846 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NrlP54846 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NrlP54846 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NrlP54846 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NrlP54846 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NrlP54846 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NrlP54846 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NrlP54846 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NrlP54846 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NrlP54846 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NrlP54846 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NrlP54846 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NrlP54846 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NrlP54846 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NrlP54846 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NrlP54846 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NrlP54846 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NrlP54846 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NrlP54846 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NrlP54846 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NrlP54846 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NrlP54846 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NrlP54846 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NrlP54846 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NrlP54846 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NrlP54846 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NrlP54846 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NrlP54846 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NrlP54846 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NrlP54846 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NrlP54846 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NrlP54846 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NrlP54846 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NrlP54846 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NrlP54846 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NrlP54846 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NrlP54846 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms