Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ephb3P54754 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ephb3P54754 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms