Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad23aP54726 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad23aP54726 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms