Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PctpP53808 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PctpP53808 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PctpP53808 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PctpP53808 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PctpP53808 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PctpP53808 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PctpP53808 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PctpP53808 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PctpP53808 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PctpP53808 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PctpP53808 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PctpP53808 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PctpP53808 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PctpP53808 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PctpP53808 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PctpP53808 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PctpP53808 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PctpP53808 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PctpP53808 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PctpP53808 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PctpP53808 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PctpP53808 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PctpP53808 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PctpP53808 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PctpP53808 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PctpP53808 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PctpP53808 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PctpP53808 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PctpP53808 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PctpP53808 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PctpP53808 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PctpP53808 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PctpP53808 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PctpP53808 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PctpP53808 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PctpP53808 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PctpP53808 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PctpP53808 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PctpP53808 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PctpP53808 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PctpP53808 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PctpP53808 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PctpP53808 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PctpP53808 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PctpP53808 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PctpP53808 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PctpP53808 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PctpP53808 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PctpP53808 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PctpP53808 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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