Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fdft1P53798 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms