Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Dbx1P52950 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dbx1P52950 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Dbx1P52950 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Dbx1P52950 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Dbx1P52950 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Dbx1P52950 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Dbx1P52950 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Dbx1P52950 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dbx1P52950 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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