Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc1a1P51906 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms