Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gpc4P51655 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms