Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa-rs12P50716 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa-rs12P50716 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms