Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt6aP50446 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt6aP50446 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt6aP50446 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms