Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpbP50405 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpbP50405 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpbP50405 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpbP50405 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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SftpbP50405 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SftpbP50405 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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