Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cav1P49817 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cav1P49817 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cav1P49817 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cav1P49817 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cav1P49817 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms