Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psen1P49769 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psen1P49769 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms