Protein–RNA interactions for Protein: P49722

Psma2, Proteasome subunit alpha type-2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma2P49722 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psma2P49722 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psma2P49722 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma2P49722 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma2P49722 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma2P49722 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma2P49722 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma2P49722 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma2P49722 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psma2P49722 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms