Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrprbP47758 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrprbP47758 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms