Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkn1bP46414 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms