Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf4P43488 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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