Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Etv1P41164 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Etv1P41164 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Etv1P41164 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms