Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ighmbp2P40694 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms