Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VhlP40338 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VhlP40338 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VhlP40338 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VhlP40338 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VhlP40338 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VhlP40338 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VhlP40338 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VhlP40338 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VhlP40338 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VhlP40338 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VhlP40338 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VhlP40338 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VhlP40338 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VhlP40338 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VhlP40338 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VhlP40338 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VhlP40338 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VhlP40338 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
VhlP40338 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
VhlP40338 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
VhlP40338 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VhlP40338 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
VhlP40338 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VhlP40338 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
VhlP40338 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
VhlP40338 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VhlP40338 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VhlP40338 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VhlP40338 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VhlP40338 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VhlP40338 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VhlP40338 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VhlP40338 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VhlP40338 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VhlP40338 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VhlP40338 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VhlP40338 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VhlP40338 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VhlP40338 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VhlP40338 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VhlP40338 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VhlP40338 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VhlP40338 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VhlP40338 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VhlP40338 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VhlP40338 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VhlP40338 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VhlP40338 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VhlP40338 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VhlP40338 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VhlP40338 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VhlP40338 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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