Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin1P35438 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms