Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms