Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdh15P33146 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdh15P33146 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms