Protein–RNA interactions for Protein: P32211

Chrm4, Muscarinic acetylcholine receptor M4, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm4P32211 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms