Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc11P31313 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hoxc11P31313 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hoxc11P31313 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hoxc11P31313 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxc11P31313 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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