Protein–RNA interactions for Protein: P30873

Sstr1, Somatostatin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr1P30873 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sstr1P30873 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sstr1P30873 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms