Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pabpc1P29341 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pabpc1P29341 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms