Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kif5cP28738 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kif5cP28738 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms