Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrbP28704 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrbP28704 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrbP28704 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrbP28704 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrbP28704 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrbP28704 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RxrbP28704 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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