Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk11bP24788 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk11bP24788 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms